Предложен метод оценки публикационной активности образовательных и научных организаций, учитывающий явление соавторства в статьях, возможную аффилированность разных соавторов одной и той же статьи с разными организациями, а также возможную аффилированность одного и того же автора статьи с двумя или большим количеством организаций. Предложенный способ оценки публикационной активности организаций напрямую связан с предлагавшимися ранее методами оценки публикационной активности отдельных ученых, когда было учтено соавторство в публикациях. Разобран пример, показывающий, как влияет на показатели публикационной активности организации учет соавторства и неоднозначности (неединственности) аффилиации у статей, включаемых организацией в свои отчеты.