В статье показано, что в модернизации высшего профессионального образования важную роль играет социальное партнёрство, которое следует понимать не только как механизм взаимодействия между организациями, заинтересованными в качественной подготовке будущих профессионалов в соответствии с выбранной специализацией, но и как междисциплинарность в направлениях подготовки. Рассмотрены особенности реализации транспрофессиональной подготовки на примере технического вуза. Представлена схема социального партнёрства, реализованная в Физико-технологическом институте УрФУ по направлению «Биотехнические системы и технологии»