Целостная концепция объекта в биологической картине мира предполагает обращение к атомистическим принципам, поскольку для исследования живых систем необходимым является определение системы как комплекса взаимосвязанных элементов. Живая система вступает во взаимодействие с целым комплексом внешних отношений и связей, что приводит к интерпретации принципа атомизма в контексте обсуждения особенностей процессов самоорганизации, образования устойчивой структуры в природе и развития живых систем.