Цель работы - анализ научной результативности университетов на основе методологий институциональной экономической теории. Новизна работы заключается в том, что разработана авторская методика количественной оценки эффективности научной результативности университетов, в отличие от известных, позволяющая выявить проблемы институционального обеспечения научной деятельности. В ходе исследования применялись методы системного, логического и экономического анализа, при обработке эмпирической информации использовались методы статистического анализа, корреляционного анализа. В результате исследования были идентифицированы институты научной результативности университета, предложены критерии эффективности этих институтов. Университеты Уральского федерального округа были сгруппированы по параметрам качества институтов научной результативности (в т.ч. наличию эффективных институтов, институциональных ловушек, институциональных дисфункций). Выявлены некоторые зависимости между эффективностью институтов научной результативности и источниками финансирования (в т.ч. РФФИ, РГНФ, Министерством образования и науки РФ и др.).