Предложен алгоритм сопоставления инновационно-технологических характеристик фармацевтической продукции с использованием технологий data-mining (поиск ассоциаций, классификация и кластеризация данных). Проведен отбор патентно-конъюнктурных параметров инновационной продукции фармацевтических предприятий. В качестве основного различительного математического параметра объектов со схожим потребительским назначением использовалось расстояние характеристики объекта до центра кластера. Метод может быть успешно применен как инструмент поддержки принятия решений, требующих сравнительной оценки коммерческого потенциала инновационной продукции промышленных предприятий высоко- технологического сектора.