Изобретение относится к области биотехнологии. Предложен способ получения биоэтанола из водорослей. Способ включает предварительное формирование биомассы, инициирование ее распада путем ферментативного гидролиза, введение в распадающуюся биомассу дрожжей для образования бродящего раствора и отделение получившегося биоэтанола. При этом в качестве водорослей используют пресноводные растения, предварительное формирование биомассы осуществляют на промышленной воде ТЭЦ и ТЭС, ферментативный гидролиз проводят с помощью комплексов ферментов целлюлаз, гемицеллюлаз, пектиназ и десульфатаз при температуре 45-85°С за счет сбросного тепла ТЭЦ и ТЭС, а отделение биоэтанола начинают, когда уровень биоэтанола в бродящем растворе составляет выше 4-9% объема. Изобретение обеспечивает энергосберегающее получение биоэтанола ферментативным гидролизом с возможностью очищения технической воды ТЭЦ и ТЭС.